KEGG

KEGG（京都基因与基因组百科事典）は、分子レベルの情報から細胞、生物個体、生態系、生物圏に至る生物システムの高次機能と有用性を理解するためのデータベースリソースです。ゲノム配列決定やその他のハイスループット実験技術によって生成された大規模な分子データセットを統合し、生物学的機能を体系的に解析するための多彩なコンテンツを提供します。具体的には、代謝経路、シグナル伝達経路、疾患関連経路などのパスウェイマップ（KEGG Pathway）を収録しており、遺伝子や化合物、酵素、反応を関連付けて視覚化できます。また、機能オルソログ（KEGG Orthology: KO）を用いた遺伝子機能の予測や、各生物種のゲノム遺伝子カタログ（KEGG Genes）の検索、低分子化合物（KEGG Compound）や化学反応（KEGG Reaction）、糖鎖（KEGG Glycan）などの構造情報も網羅しています。さらに、ユーザー自身のデータ（トランスクリプトーム、プロテオーム、メタボロームなど）をパスウェイ上にマッピングするためのツール「KEGG Mapper」、アノテーション自動化システム「KEGG Annotation」、プログラムからデータベースを参照・解析するためのAPI、バルクダウンロード用のFTPサービス、有償サブスクリプションによる高度な利用まで、研究目的に応じた多様なアクセス方法を整備しています。医学関連では、医薬品と疾患の関連情報（KEGG DRUG, KEGG DISEASE）も提供し、創薬や疾患メカニズムの解明に寄与します。学術研究だけでなく、バイオインフォマティクス教育や産業応用にも広く利用され、常に最新の研究成果に基づいてアップデートが行われています。これにより、生命科学の基礎研究から臨床応用までの幅広い分野で、ユーザーはシステム生物学的な洞察を得ることができます。