miEAA

miEAA (miRNA Enrichment Analysis and Annotation) ist ein webbasiertes Werkzeug zur funktionellen Analyse von miRNA-Sätzen. Es ermöglicht Forschern, eine Liste von miRNAs oder miRNA-Vorläufern hochzuladen und diese auf statistisch signifikante Anreicherungen in verschiedenen biologischen Kategorien zu untersuchen. Die Plattform greift auf aktuelle Datenbanken wie miRBase zurück und bietet integrierte Konverter, um verschiedene miRNA-Identifikatoren (z. B. miRBase-ID, miRNA-Vorläufer) ineinander umzuwandeln. Nutzer können entweder eigene miRNA-Listen manuell eingeben oder Beispieldatensätze aus der Webseite verwenden. Die Analyse umfasst Anreicherungstests gegen Hintergrunddatensätze wie gesamte miRNA-Genome oder gewebespezifische Profile. Die Ergebnisse werden tabellarisch und graphisch dargestellt, mit Angabe von p-Werten, adjustierten p-Werten und Anreicherungsfaktoren. Zusätzlich bietet miEAA eine API für programmatischen Zugriff, sodass die Funktionalität in eigene Analyseworkflows eingebunden werden kann. Die Bedienung erfolgt über eine klare Weboberfläche mit Tutorials und einem Changelog, der die Versionshistorie dokumentiert. Ein Besonderheit ist die Unterstützung sowohl für reife miRNA als auch für miRNA-Vorläufer (Precursor), was die Anwendung in unterschiedlichen experimentellen Kontexten erlaubt. Die Ergebnisse können heruntergeladen oder direkt in der Browseransicht interpretiert werden. Die Webseite wird von der Universität des Saarlandes betrieben und ist seit 2016 verfügbar, mit regelmäßigen Aktualisierungen (zuletzt Version 2.1 im Mai 2023). miEAA richtet sich an Biologen und Bioinformatiker, die miRNA-Expressionsdaten aus Microarrays, RNA-Seq oder anderen Hochdurchsatzmethoden analysieren möchten. Die funktionelle Annotation deckt Kategorien wie Signalw