TransmiR

TransmiR是一个专注于转录因子（TF）与微RNA（miRNA）调控关系的数据库。它提供了详尽的TF-miRNA调控数据，包括从文献中收集的5,095个调控条目，涵盖约946个TF和1,072个miRNA，以及29个生物物种和2,285篇出版物。此外，它还整合了来自ChIP-seq证据的6,366,938个TF-miRNA调控数据，涉及5个物种。用户可以通过“搜索”页面和“网络”页面分别查找和图形化可视化这些转录调控数据。在网络模块中，用户可以获取特定疾病和性别依赖性的TF-miRNA调控网络。此外，还提供了“富集分析”模块，用于识别可能调控感兴趣miRNA列表的显著TF。最后，还实现了“预测”模块，基于人类TF的结合基序矩阵预测TF-miRNA调控。TransmiR v3.0对学术用户免费开放，用户还可以下载数据集进行进一步分析。这个平台非常适合研究人员和学者，尤其是那些对分子生物学、基因调控和生物信息学感兴趣的人群。通过TransmiR，用户可以轻松探索TF与miRNA之间的复杂关系，从而推动相关领域的研究进展。